一项开创性的当日检测已被用于在重症监护儿童中检测隐藏和耐药感染，因为显然，等着细菌在培养皿里长出来已经不再是医学精湛的巅峰了。

伦敦大奥蒙德街医院（GOSH）的100多名危重年轻患者的呼吸道样本被送去进行所谓的宏基因组检测。它可以从单个样本中识别细菌、病毒和真菌，这在许多情况下会影响医生的处方。宏基因组学可以检测标准测试漏掉的感染，这意味着一些危重患者会有更好的结果——这个概念本不该让任何人惊讶，但依然值得欢迎。

今年3月，10岁的Willow Crowther因肺炎病危，引发癫痫发作和多次心脏骤停。来自肯特郡的Willow被送入GOSH的重症监护室。她的妈妈Stacey Moore被告知她只有50%的生存机会。“顾问说……我们应该叫家人来跟她告别。她就是这么危急，离死亡就是这么近。”

GOSH的团队使用了宏基因组学——一种通过测序样本中所有遗传物质来工作的诊断测试，与临床医生需要提前决定要找什么的传统方法形成对比。该测试发现Willow有一种耐药细菌感染，需要使用与她之前被处方不同的抗生素。“他们能为她提供这样的测试，这一点至关重要。它救了她的命，”Stacey说。“她能活下来是个奇迹，我们对此非常感激，”Willow的爸爸Russ补充道。

经过正确的治疗，Willow最终从感染中康复，但需要在医院住了几个月。她是这家儿童医院众多受益于这种新型检测的患者之一。

在2024-5年的一项研究中，宏基因组检测被用于GOSH儿科重症监护室（ICU）的122名危重儿童。研究结果现已发表在《柳叶刀微生物》上。

宏基因组检测分析样本中的所有遗传物质，可以检测数千种不同的病原体。相比之下，识别细菌最常见的方法是在培养皿中培养它们，这项技术自维多利亚时代以来一直在使用。另一种测试PCR可以识别病毒和某些细菌，但医生需要指定他们想要检测什么。

GOSH的宏基因组学检测能够识别样本中大约十分之九的细菌和病毒以及所有真菌。在四分之一的病例中，结果影响了处方决策，包括开始、停止或更换抗生素。

GOSH儿科重症监护医学顾问、该研究的合著者Sam Ray博士说，传统检测要求临床医生对他们要寻找的感染做出有根据的猜测。“这项研究帮助我们发现了原本会漏掉的感染，让儿童得到正确的治疗，并在我们知道抗生素无效时停止使用。消除不必要的治疗对于对抗日益严重的抗菌素耐药性至关重要。”

GOSH的宏基因组检测还检测到50种常规诊断未识别的微生物，这意味着它可以在对抗新感染方面发挥早期预警作用。GOSH宏基因组服务负责人、该研究的共同资深作者Julianne Brown博士说，这种新检测正在逐步推广到英国约30个治疗成人和儿童的重症监护室。“它可能成为识别构成大流行威胁的新感染的有力工具，”她补充道。“未来，如果出现一种可能引发下一次大流行的新神秘病原体，我们将很快检测到它并采取正确的措施。”

GOSH的项目建立在Guy's和St Thomas' NHS信托基金的试验基础上，该信托基金首次使用宏基因组学来检测耐