Öncü bir aynı gün testi, yoğun bakımdaki çocuklarda gizli ve ilaca dirençli enfeksiyonları tespit etmek için kullanıldı, çünkü görünüşe göre bakterilerin bir kapta büyümesini beklemek artık tıbbi gelişmişliğin zirvesi değil.

Londra'daki Great Ormond Street Hastanesi'nde (GOSH) 100'den fazla kritik hasta gençten alınan solunum örnekleri, metagenomik test olarak bilinen yönteme gönderildi. Bu test, tek bir örnekten bakteri, virüs ve mantarları tanımlayabiliyor ve çoğu durumda doktorların ne reçete edeceğini etkiliyor. Metagenomik, standart testlerin kaçırdığı enfeksiyonları tespit edebiliyor, bu da bazı kritik hastalar için daha iyi sonuçlar anlamına geliyor - kimseyi şaşırtmaması gereken ama yine de memnuniyetle karşılanan bir kavram.

Mart ayında, 10 yaşındaki Willow Crowther, nöbet ve çoklu kalp durmasına yol açan zatürre ile tehlikeli şekilde hastalandı. Kent'ten Willow, GOSH'ta yoğun bakıma alındı. Annesi Stacey Moore'a hayatta kalma şansının %50 olduğu söylendi. "Doktor... ailemizi ondan veda etmek için getirmemiz gerektiğini söyledi. Ne kadar kritik ve ölüm tehlikesi ne kadar yüksekti."

GOSH'taki ekip metagenomik kullandı - mevcut tüm genetik materyali dizileyerek çalışan bir tanı testi; klinisyenlerin önceden ne aradıklarına karar vermesi gereken geleneksel yöntemlerin aksine. Test, Willow'un reçete edilen antibiyotikten farklı bir antibiyotik gerektiren ilaca dirençli bir bakteriyel enfeksiyonu olduğunu tespit etti. "Onun için orada bir test bulunması çok önemliydi. Hayatını kurtardı," dedi Stacey. "Burada olması bir mucize ve bunun için son derece minnettarız," diye ekledi Willow'un babası Russ.

Doğru tedaviyle Willow sonunda enfeksiyonundan kurtulabildi, ancak hastanede birkaç ay geçirmesi gerekti. O, çocuk hastanesindeki yeni test türünden faydalanan birçok hastadan biri.

2024-5'te yapılan bir çalışmada, GOSH'taki pediatrik yoğun bakım ünitesinde (YBÜ) 122 kritik hasta çocukta metagenomik test kullanıldı. Sonuçlar şimdi Lancet Microbe'da yayımlandı.

Metagenomik test, bir örnekteki tüm genetik materyali analiz eder ve binlerce farklı patojeni tespit edebilir. Buna karşılık, bakterileri tanımlamanın en yaygın yöntemi, Viktorya döneminden beri kullanılan bir teknoloji olan Petri kaplarında kültürlemeye çalışmaktır. Bir diğer test olan PCR, virüsleri ve bazı bakterileri tanımlayabilir, ancak doktorların neyi tespit etmeye çalıştıklarını belirtmeleri gerekir.

GOSH'taki metagenomik test, örneklerdeki bakterilerin ve virüslerin yaklaşık onda dokuzunu ve tüm mantarları tanımlayabildi. Vakaların dörtte birinde sonuçlar, bir antibiyotiğe başlama, durdurma veya değiştirme dahil olmak üzere reçete kararlarını etkiledi.

GOSH'ta pediatrik yoğun bakım tıbbı danışmanı ve çalışmanın ortak yazarı Dr. Sam Ray, geleneksel testin klinisyenlerin hangi enfeksiyonu aradıklarına dair eğitimli bir tahmin yapmasını gerektirdiğini söyledi. "Çalışma, kaçıracağımız enfeksiyonları tespit etmemize, çocukları doğru tedaviye yönlendirmemize ve işe yaramayacağını bildiğimizde antibiyotikleri durdurmamıza yardımcı oldu. Gereksiz tedaviyi kaldırmak, artan antimikrobiyal dirençle mücadelede inanılmaz derecede önemlidir."

GOSH'taki metagenomik test ayrıca rutin teşhislerle tanımlanmayan 50 organizma tespit etti, bu da yeni enfeksiyonlara karşı erken uyarı rolü oynayabileceği anlamına geliyor. GOSH Metagenomik Servisi başkanı ve çalışmanın ortak kıdemli yazarı Dr. Julianne Brown, yeni testin Birleşik Krallık genelinde hem yetişkinleri hem de çocukları tedavi eden yaklaşık 30 yoğun bakım ünitesine kademeli olarak yaygınlaştırıldığını söyledi. "Pandemi tehdidi oluşturan yeni enfeksiyonları tanımlamak için güçlü bir araç olabilir," diye ekledi. "Gelecekte, bir sonraki pandeminin nedeni olabilecek yeni bir gizemli patojen ortaya çıkarsa, bunu çok hızlı bir şekilde tespit eder ve doğru önlemleri alırız."

GOSH'taki proje, metagenomikleri ilk kez kullanarak test yapan Guy's ve St Thomas' NHS Trust'taki denemelere dayanıyor.