Een baanbrekende test die dezelfde dag resultaat oplevert, is gebruikt om verborgen en medicijnresistente infecties op te sporen bij kinderen op de intensive care, want blijkbaar is wachten tot bacteriën in een schaaltje groeien niet langer het toppunt van medische verfijning.

Ademhalingsmonsters van meer dan 100 ernstig zieke jonge patiënten in het Great Ormond Street Hospital (GOSH) in Londen werden opgestuurd voor wat bekendstaat als metagenomische testing. Het kan bacteriën, virussen en schimmels identificeren uit één enkel monster, wat in veel gevallen bepaalt wat artsen voorschrijven. Metagenomica kan infecties opsporen die standaardtests missen, wat betekent betere uitkomsten voor sommige ernstig zieke patiënten – een concept dat niemand zou moeten verbazen, maar desalniettemin welkom is.

In maart werd de 10-jarige Willow Crowther levensgevaarlijk ziek door een longontsteking, die een epileptische aanval en meerdere hartstilstanden veroorzaakte. Willow, uit Kent, werd opgenomen op de intensive care van GOSH. Haar moeder, Stacey Moore, kreeg te horen dat ze 50% kans had om te overleven. "De consulent zei... dat we onze familie moesten laten komen om afscheid van haar te nemen. Zo kritiek was het en zo groot was het gevaar dat ze zou overlijden."

Het team van GOSH gebruikte metagenomica – een diagnostische test die werkt door al het aanwezige genetische materiaal te sequensen, in tegenstelling tot conventionele methoden waarbij clinici vooraf moeten beslissen waarnaar ze zoeken. De test identificeerde dat Willow een medicijnresistente bacteriële infectie had waarvoor een ander antibioticum nodig was dan hetgeen haar was voorgeschreven. "Het feit dat ze daar een test voor haar beschikbaar hadden, was van het grootste belang. Het heeft haar leven gered," zei Stacey. "Het is een wonder dat ze er nog is en daar zijn we enorm dankbaar voor," voegde Willows vader, Russ, eraan toe.

Met de juiste behandeling kon Willow uiteindelijk herstellen van haar infectie, maar ze had verschillende maanden in het ziekenhuis nodig. Ze is een van de vele patiënten in het kinderziekenhuis die profiteren van het nieuwe type test.

Tijdens een studie in 2024-5 werd metagenomische testing gebruikt bij 122 ernstig zieke kinderen op de pediatrische intensive care (ICU) van GOSH. De resultaten zijn nu gepubliceerd in The Lancet Microbe.

Metagenomische testing analyseert al het genetische materiaal in een monster en kan duizenden verschillende pathogenen detecteren. Daarentegen is de meest gebruikelijke methode om bacteriën te identificeren het proberen te kweken in petrischaaltjes, een technologie die al sinds de Victoriaanse tijd wordt gebruikt. Een andere test, PCR, kan virussen en sommige bacteriën identificeren, maar artsen moeten specificeren wat ze proberen op te sporen.

Metagenomische testing bij GOSH was in staat om ongeveer negen op de tien bacteriën en virussen en alle schimmels in monsters te identificeren. In een kwart van de gevallen beïnvloedden de resultaten de voorschrijfbeslissingen, waaronder het starten, stoppen of veranderen van een antibioticum.

Dr. Sam Ray, consulent in pediatrische intensive care geneeskunde bij GOSH en co-auteur van de studie, zei dat traditionele testing vereiste dat clinici een educated guess maakten over welke infectie ze zochten. "De studie heeft ons geholpen infecties op te sporen die we zouden hebben gemist, kinderen de juiste behandeling te geven en antibiotica te stoppen wanneer we weten dat ze niet zullen werken. Het verwijderen van onnodige behandeling is ongelooflijk belangrijk in de strijd tegen toenemende antimicrobiële resistentie."

Metagenomische testing bij GOSH detecteerde ook 50 organismen die niet door routinediagnostiek werden geïdentificeerd, wat betekent dat het een vroege waarschuwingsrol zou kunnen spelen tegen nieuwe infecties. Dr. Julianne Brown, hoofd van de GOSH Metagenomics Service en co-senior auteur van de studie, zei dat de nieuwe testing geleidelijk werd uitgerold naar ongeveer 30 intensive care-afdelingen in het Verenigd Koninkrijk die zowel volwassenen als kinderen behandelen. "Het zou een krachtig hulpmiddel kunnen zijn voor het identificeren van nieuwe infecties die een pandemische dreiging vormen," voegde ze eraan toe. "In de toekomst, als er een nieuw mysterieus pathogeen zou zijn dat de oorzaak van de volgende pandemie zou kunnen zijn, zouden we dat zeer snel detecteren en de juiste maatregelen nemen."

Het project bij GOSH bouwt voort op proeven bij Guy's and St Thomas' NHS Trust die voor het eerst metagenomica gebruikten om te testen op re