冰人奥茨,欧洲最著名的木乃伊,身上爬满了微生物——有些早已死去,有些在数千年后仍勉强度日,还有一些非常现代。这位铜器时代的人在奥茨塔尔阿尔卑斯山去世后,独自被遗忘5300年,直到1991年一群徒步者偶然发现了他冻干般的遗骸。自那以后,他受到了科学家们的极大关注:他们测序了他的DNA,仔细研究了他最后一餐和肠道微生物的残骸,并检查了他的衣物和破损工具。如今,奥茨安息在意大利南蒂罗尔考古博物馆的高科技冷藏室中,但事实证明,他的身体仍然是少数几种耐寒酵母菌的家园,这些酵母菌可能自他死后不久就一直陪伴着他。

微生物学家穆罕默德·S·萨汉(来自私人研究机构Eurac Research的木乃伊研究所)及其同事最近从奥茨的胃部、体内融水、皮肤拭子中取样,甚至从冷冻储藏室和外部实验室采集了空气微生物。他们还从1991年奥茨遗体旁取回的一块冻土中取样。我们通过2019年的一项研究已经对奥茨的肠道微生物了解颇多,但萨汉团队希望获得更全面的图景。他们不只是对奥茨身上所有微生物DNA进行测序,而是想了解哪些物种真正属于他古老的单人生态系统,哪些是现代污染物。

萨汉团队培养了一些样本,并对另一些进行了鸟枪法宏基因组测序,即对样本中所有漂浮的DNA片段进行测序。在奥茨的肠道中,萨汉团队——如同先前研究一样——发现了大量细菌的古DNA,这些细菌符合我们对古代“非西化”肠道微生物组的预期。但在木乃伊的其他部位,团队还发现了一些实际上并未死亡的微生物。

奥茨被保存在精心维护的条件下,尽可能接近将他保存了5000多年的冰川环境。冷藏室温度保持在零下6摄氏度,湿度99%,由经过紫外线处理的水雾细心维持。这足以保护木乃伊免受大多数通常分解人类遗骸的微生物侵害。但萨汉团队惊讶地发现,这里也是奥茨从山上带来的少数微生物的完美栖息地。

在木乃伊样本中,萨汉团队发现了四种耐寒酵母菌株,它们与北极冰川、南极洲以及意大利和俄罗斯高山中发现的类似酵母菌密切相关。与奥茨早已死去的肠道细菌(只留下破碎老化的DNA片段)不同,这些酵母菌似乎还活着并正在繁殖(尽管速度,嗯,慢如冰川)。Eurac木乃伊研究所所长、该研究的合著者弗兰克·马克西纳在新闻稿中表示:“这些酵母菌陪伴奥茨走过了数千年的漫长旅程。”(奥茨大概不会觉得这很安慰,但谁知道呢。)

这些酵母菌——对于真菌爱好者来说,它们是Phenolifera、Glaciozyma、Goffeauzyma和Mrakia属——出现在奥茨的皮肤上、胃里以及从他体内取出的水样中。萨汉团队从样本中培养出了活酵母,但他们的鸟枪法宏基因组结果也揭示了许多短DNA片段,其中大部分带有DNA分子随时间降解时产生的损伤。这是古DNA的标志,意味着这些酵母菌很可能在奥茨死后不久就开始在他体内外生活。当萨汉团队将2010年采集的样本与2019年的样本进行比较时,他们发现平均而言片段更长、损伤更少——换句话说,混合物中有更多近期DNA,这表明