Долгосрочное наблюдение за хроническими раками крови выявило серьезные генетические различия между пациентами, чье состояние остается стабильным, и теми, чьи заболевания со временем становятся более тяжелыми. Полученные данные позволяют предположить, что изменения ДНК могут помочь врачам улучшить диагностику, точнее контролировать пациентов, оценивать эффективность лечения и выявлять признаки прогрессирования за годы до того, как симптомы станут очевидными.

Опубликованное в Cancer Discovery исследование было проведено под руководством ученых Института Wellcome Sanger и их коллег. Команда объединила генетический анализ с подробными клиническими записями, чтобы изучить, как хронические раки крови могут развиваться в течение нескольких десятилетий. Результаты также были представлены на конференции Американской ассоциации исследований рака (AACR) в Сан-Диего.

Миелопролиферативные новообразования (МПН) - это группа редких, длительно текущих раков крови, которые начинаются в костном мозге, где производятся клетки крови. У людей с МПН костный мозг производит определенные клетки крови бесконтрольно. Около 40 000 человек в Великобритании живут с МПН, и примерно 4 000 новых случаев диагностируется каждый год. Эти раки часто прогрессируют медленно. Они могут начинаться с мутаций, или изменений в ДНК, которые возникают очень рано в жизни, с последующими дополнительными мутациями, накапливающимися в течение нескольких десятилетий.

Большинство МПН связано с мутациями в генах JAK2, CALR или MPL. Однако около 10 процентов пациентов не имеют ни одной из этих распространенных генетических изменений. В таких случаях врачи могут диагностировать рак в основном по внешнему виду клеток в костном мозге. В результате некоторые пациенты могут получать лечение рака, включая химиотерапию, без окончательных генетических доказательств того, что у них есть скрытый рак крови.

Течение хронического рака крови сильно различается у разных пациентов. Некоторые люди чувствуют себя хорошо в течение многих лет и нуждаются лишь в легком лечении, пока их болезнь остается стабильной. Другие со временем развивают более серьезные состояния, включая лейкемию или миелофиброз, который вызывает рубцевание в костном мозге. Врачи не всегда могут заранее определить, чья болезнь останется стабильной, а чья будет прогрессировать. Поэтому исследователи изучили, могут ли генетические изменения выявить, какие пациенты подвержены большему риску. Они также проверили, действительно ли люди, у которых отсутствуют распространенные мутации МПН, имеют рак крови.

Команда наблюдала за 30 пациентами с хроническими раками крови, в основном МПН. Они объединили полногеномное секвенирование с обширной клинической информацией, включая почти 8 000 результатов анализов крови, записи о лечении и данные о болезни. Более 450 образцов были исследованы с помощью повторного геномного тестирования. Некоторые пациенты наблюдались в рамках рутинного клинического ухода до 25 лет. Длительный период наблюдения связал геномные исследования в Институте Sanger с рутинным уходом за пациентами в Фонде NHS Университетских больниц Кембриджа. Это позволило ученым наблюдать, как популяции клеток крови менялись со временем, и дало более широкое представление о том, как рак развивается.

Используя ДНК, взятую из клеток крови, исследователи создали генетические «генеалогические древа». Эти реконструкции позволили им проследить происхождение раковых клонов, групп генетически идентичных клеток, которые позже способствовали прогрессированию болезни. Анализ выявил различные модели эволюции у пациентов с МПН. У людей, чье заболевание оставалось клинически стабильным, популяции клеток крови были генетически «устойчивыми» и приобретали мало дополнительных мутаций или не приобретали их вовсе. Напротив, у пациентов с прогрессированием заболевания со временем развивались новые изменения ДНК.

Результаты позволяют предположить, что прогрессирование хронических раков крови может быть биологически «закодировано» за годы до того, как состояние пациента заметно ухудшится. Мутации, связанные с будущим прогрессированием, могут быть обнаружены задолго до ухудшения симптомов или до того, как стандартные клинические тесты покажут серьезные изменения.

Исследователи также изучили пациентов, у которых отсутствовали мутации в JAK2, CALR или MPL. Они реконструировали «генеалогические древа» примерно из 20